Vad är proteinanalys
Uppgraderat instrument för analys av proteiner i klinisk forskning
- Ett av kännetecknen för enheterna inom Core Facilities är öppenhet och när denna nya analysutrustning inom masspektrometri nu placeras vid PCF blir den tillgänglig för alla forskare, särskilt vid Sahlgrenska akademin och Västra Götalandsregionen, säger Carina Sihlbom, enhetschef på Proteomics Core Facility.
Elisabet Carlson, chef för Core Facilities, framhäver också hon vikten av samverkan inom regionen, samt att ALF-medlen är viktiga för tillgängliggörandet av tung, avancerad utrustning:
- Genom samverkan inom regionen kan vi bibehålla hög nivå både vid teknisk utrustningen men också på den expertis samt kompetens som vi kan erbjuda. Det är därför glädjande att se fortsatta satsningar på forskningsinfrastruktur, säger Elisabet.
Forskning med spjutspets
Kvantifiering av protein har utförts i cirka 40 procent av studierna som genomförts vid enheten de senaste tre åren. Därför tror Carina att uppgraderingen av den n
Proteinerna som fixar (nästan) allt
Sedan förstod forskarna för att varenda gen kan producera flera versioner av varenda protein. Det ger ungefär 90 proteinvarianter. Och proteinerna kan förändras även efter tillverkning. Till exempel genom att en annan molekyl fäster vid dem. detta påverkar proteinerna på flera sätt, förklarar Janne Lehtiö, professor i proteomik vid institutionen för onkologi-patologi nära Karolinska Institutet.
– De kemiska modifieringar som sker hos proteiner efter att de har bildats påverkar fanns i cellen de kommer att befinna sig, hur stabila de är och vilka andra proteiner dem samverkar med. Allt detta påverkar deras funktion.
Han beskriver det hela med en bild, där ett träd som gör plommon liknas vid en gen såsom tillverkar ett protein.
– Man kan tänka att detta är plommon från ett och samma träd, dock ändå är inte plommon i en tårta identisk sak som ett torkat plommon i en fläskstek. På motsvarande sätt kan en gen producera proteinvar
Lovande metod för snabbare proteinanalys
2 maj
Margareta Ramström besitter under sitt avhandlingsarbete utvecklat en ny, snabbare teknik för analys av proteiner i kroppsvätskor. Denna förmå på sikt komma att användas för diagnos från ett flertal olika sjukdomar. Disputationen äger rum nära Uppsala universitet den 4 maj.
Proteiner är biologiska makromolekyler som deltar i de flesta livsviktiga processer inom kroppen, såsom transport av näringsämnen och katalys från kemiska reaktioner. Förändringar av proteininnehållet i till modell kroppsvätskor och vävnader kan ofta korreleras med olika sjukdomar. Det är därför av stor vikt för att utveckla effektiva och pålitliga verktyg för studier från dessa molekyler.
Under sitt avhandlingsarbete har Margareta Ramström utvecklat en metod baserad på masspektrometri för att analysera proteiner i kroppsvätskor. Genom att först separera
Enkel och billig metod för proteinanalyser utvecklad inom Uppsala
Kan enligt forskarna dra ner kostnaderna rejält för att diagnostisera sjukdomar.
En ny metod för för att studera proteiner, som inte kräver avancerad utrustning, specifika laboratorier eller dyra reagens, har tagits fram nära Uppsala universitet.
I ett pressmeddelande beskriver forskarna hur metoden skulle kunna utvecklas vidare för att användas inom vården, till exempel för sjukdomsdiagnostik.
I dagsläget behövs ofta mycket avancerad och dyr utrustning för att analysera proteiner och hur de interagerar med varandra.
Antikroppar binder till proteiner
Metoden bygger på att antikroppar binder antingen till två ställen på samma protein eller mot två olika proteiner som befinner sig mycket nära varandra.
Till antikropparna har man kopplat dna-strängar som kan sätta ihop sig med varandra om de kommer tillräckliga nära. Då startar en kedjereaktion där fler samt fler dna-strängar kopplar ihop sig. På varje dna-strän